La mise en place du Centre de Calcul de la Fondation MSH par le mathématicien Bernard Jaulin date de la fin de l'année 1963. L'un de ses services, le Bureau d'Etudes sémiologiques, préexistait dès 1961, et était dirigé par l'archéologue Jean-Claude Gardin. Le Centre a continué au cours de l'année 1964 à mettre en place son organisation et à poursuivre les travaux qu'il avait entrepris. Avant son déménagement pour la Maison des Sciences de l'Homme en 1970, il a été transféré du 14 rue Monsieur le Prince à la Cité de Pusy, dans le 17e arrondissement.

A cette époque, il comprenait, en plus du chef de service, un chef de laboratoire, 4 analystes, 1 programmeur, 2 bibliographes et 4 secrétaires. Il employait déjà un certain nombre de "collaborateurs techniques" payés sur vacations. Les travaux de recherche du Centre ont porté sur les méthodes de documentation et d'information dans les sciences sociales ainsi qu'à l'emploi de l'informatique pour la recherche scientifique dans ces domaines.

Les problématiques de documentation pouvaient concerner par exemple l'analyse des données documentaires et la composition automatique de textes.

En matière de calcul, plusieurs types de problèmes furent étudiés comme la classification automatique de données, que ce soit en archéologie, en histoire, en psychiatrie ou encore en ethnologie.

A la fin des années 1968, l'étude de techniques de calcul, la réalisation et l'exploitation de programmes ainsi que les activités d'information et de documentation constituaient les principales activités du Centre, qui avait déjà noué des contacts avec d'autres chercheurs français et étrangers. Ses membres ont intégré des instances de réflexion (AFCET, Musée des arts et traditions populaires) et commencé à dispenser des enseignements (Unité de valeur "Anthropologie et Calcul" à la Sorbonne, IEDES, etc.).